No entiendo muy bien el problema en el que te encuentras, pero en el caso
de los gif animados, puedes usar Fireworks...no sé si puedas convertir
el flash, directamente en gif, pero seguro existe la forma, flah guarda ciertas
imagenes de la animacion en jpg, gif... echale una mirada a las configuraciones
flash, y en la Ayuda Flash, y la de Fireworks.
No me imagino por qué los menus no aparecen con el flash. Te aconsejo que
no desistas, a menos que por la naturaleza de la animacion quede mejor en
gif.