Hola,
Si he entendido bien tu pregunta, creo que lo unico que necesitas hacer es un delete pero poner la restricción ON DELETE CASCADE, de esta forma si borras una fila de una tabla cuya clave es primaria de las otras dos, automaticamente te borrara las filas implicadas en las otras dos tablas. Como creo que no puedo haberme explicado bien puedes echarle un vistazo al articulo http://www.desarrolloweb.com/articulos/1925.php donde te explica algo mejor lo que hace el ON DELETE CASCADE.
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