Eso lo haces desde el php.ini, como tantas otras cosas de configuración de PHP. Simplemente debes añadir en el archivo una línea, con la instrucción:
short_open_tag = 1
Yo tengo puesto en mi php.ini en mi ordenador local esta línea en el final del archivo y así consigo que me acepte esas aperturas de código PHP. Pero vigila antes si esa variable de configuración está en otra parte del archivo php.ini, para asegurarte que no la repites.
Eso es todo... de todos modos, habría que comentar que, según la documentación de PHP, el método más correcto para abrir y cerrar bloques de código PHP es con <?php. El método <? está desaconsejado, por no existir soporte a él en todas las versiones de PHP y porque da problemas a la hora de juntar en un mismo archivo código PHP y código XML.
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